از زمان قدرت‌گیری طالبان در افغانستان، این گروه با چالش‌های درونی و بیرونی بی‌شماری روبرو بوده است. چالش داخلی میان طالبان یک بحث جدی است که آن‌ها را از شناسایی جامعه جهانی محروم کرده است. عمده‌ی بحث این است که طالبان در درون خود، به چند دسته تقسیم شده‌اند و باهم مشکلات حل ناشده‌ی بسیاری دارند. مشخص است اگر دخالت برخی کشورهای حامی بزرگ طالبان، مخصوصا آمریکا، نمی‌بود، تاکنون درگیری‌های میان این گروه روی تقسیم قدرت به میان می‌آمد. طالبان حاکم در افغانستان در حال حاضر به سه دسته تقسیم می‌شوند؛ دسته‌ی رهبری طالبان شامل ملا هبت الله، ملا
