پس از روی‌کار آمدن دوباره‌ی طالبان بحث‌ها در مورد ارتباط این گروه با شبکه القاعده افزایش یافت. هرچند طالبان در اوایل ادعاهای نزدیکی این گروه با القاعده را همواره رد کرده‌اند اما کشته شدن ایمن‌الظواهری معاون شبکه القاعده در کابل نشان داد که ارتباطات طالبان با گروه القاعده همچنان مستحکم است. بهتازگی، فارن پالیسی گزارش داده است که ۱۴ گروه وابسته به القاعده از درآمد استخراج معادن توسط طالبان سود می‌برند. این گروه‌ها عبارت‌اند از جنبش ترکستان شرقی، جماعت انصارالله و تی‌تی‌پی در داخل افغانستان و القاعده در عربستان، شبه‌جزیره، یمن، عراق، سوریه، شبه‌قاره هند و شرق آفریقا در
