از زمان تأسیس کشور مستقل پاکستان در سال ۱۹۴۷ تاکنون، مناسبات دوجانبه افغانستان با پاکستان همواره دستخوش فراز و نشیب عمدتاً ناشی از اختلاف مرزی به جامانده از دورۀ استعمار بریتانیا بوده است. امیر محمد یعقوب خان در ماه مه سال ۱۸۸۷ و در خاتمه دومین جنگ افغانستان- انگلیس به موجب توافق «گندمک» بخش های بزرگی از بلوچستان فعلی پاکستان را به حکومت بریتانیایی هند واگذار کرد. همچنین عبدالرحمن خان پس از یعقوب خان در سال ۱۸۹۳ با گردن نهادن به عهدنامه دیگر، حوزه های نفوذ هند بریتانیا و افغانستان، خط مرزی موسوم به «دیوراند» را که به طول حدود
