یکی دیگر از عمده‌ترین نشانه‌های تعطیلی تفکر در مدارس دیوبندی، فرهنگ حاشیه‌خوانی و حاشیه‌نویسی است. در مدارس دینی دیوبندی به جای این‌که شما تفکرِ نقاد را بیاموزید، عمر تان در خواندنِ حواشی و شروحاتی که گذشتگان بالای کتاب‌ها نوشته‌اند صرف می‌گردد. فرهنگ حاشیه‌خوانی آن قدری که در مدارس دینی دیوبندی رایج است در جای دیگری نیست. علتش نیز این است که آموزش‌های دینی هنگامی به‌صورت سازمان‌یافته در هند آغاز شد که مراحل اولیه شکل‌گیری علوم مختلف در جهان اسلام دیگر اساساً به سر رسیده و به نوعی ایستایی و تصلب انجامیده بود و دورۀ جزم‌گرایی، قطعیت، تحشیه‌نویسی و
